Академия Ниндзя (忍者学校 (忍者アカデミー, "Ninja Akademii"), "Ninja Gakkō") - школа, в которой дети, которые поставили себе цель стать Ниндзя, обучаются в основах Нин-, Тай- и Гендзюцу, которые нужно применять в практических и теоретических тестах, что бы сдать. Техники, которым обучают в академии, зачастую относятся к уровню Е.